Durante los siguientes años, Wallace estudió y meditó junto a Su Santidad y otros grandes maestros tibetanos, a quienes también tradujo durante sus giras de enseñanzas. En 1984 retomó su formación universitaria en Estados Unidos, donde estudió física y filosofía de la ciencia y, en 1987, se doctoró con una tesis sobre la relación entre el budismo y la ciencia.